Formannskapet har avgjørelsesmyndighet i henhold til vedtatt delegasjonsreglement og innstillingsrett til kommunestyret. Formmanskapet har i tillegg ansvar for utarbeidelse av budsjett og økonomiplan.
I tillegg så har Flakstad følgende råd og utvalg:
Kontrollutvalg Hilde Rødås Johnsen - leder Knut Ivar Johansen - nestleder Ann Helen F. Jusnes
Forliksråd Arthur Johnsen - leder Asgeir Rottem Leena Pettersen
Overformynderiet Lisbeth Lennertsen - leder Eldrid Walle